根據膜組件在膜生物反應器中所處的位置不同，可以將MBR工藝分為外置式和浸沒式兩類。外置管式MBR膜組件完全獨立于生物反應器。進水經泵增壓后進入膜組件，在壓力作用下混合液中的液體透過膜得到系統(system)出水，活性污泥則被截留，并隨濃縮液回流到生物反應器內。膜組件有單獨循環（continue)泵以產生較大的過濾通量，膜表面流速3.5～5m/s，避免膜管堵塞。特性：反應器污泥濃度15-30g/
　　L、使用PDVF過流式管式膜、膜裝置外置、膜通量60-120l/m2.
　　H、生化池容積較小、污泥在膜管中高速紊流不易阻塞、壽命(lifetime)3-5年、連續（Continuity)出水較為穩定（解釋:穩固安定；沒有變動)、CIP在線清洗、每月藥劑清洗一次、設備(shèbèi)維護簡單能耗比較高。中空纖維膜紡絲機外形像纖維狀，具有自支撐作用的膜。它是非對稱膜的一種，其致密層可位于纖維的外表面／如反滲透膜，也可位于纖維的內表面(如微濾膜和超濾膜)。對氣體分離膜來說，致密層位于內表面或外表面均可。外置超濾設備自控功能可實現運行、沖洗、清洗三種模式(pattern)的運行切換，設置必要的流量、壓力、溫度等保護措施和設備聯動互鎖功能。
　　內置式MBR將膜組件置于反應器內，通過(tōng guò)自吸泵過濾混合液，曝氣器產生空氣攪動，汽水擦洗以最大化減少膜的感染。抽吸是間斷運行的，抽吸時污染物在膜的表面形成累積，而停抽時水流沖刷污染物從膜表面掉落。特點：反應器污泥濃度5-10g/
　　L、使用進口PDVF或國產PP或住友PTFE中空纖維膜絲、膜裝置內置，膜通量5-15l/m2.
　　H、生化池容積較大、膜表面易形成濃差極化導致(cause)膜容易堵塞、膜壽命(lifetime)一般1-2年住友5～10年、間歇出水不穩定（解釋:穩固安定；沒有變動)易產生膜破裂斷絲、需要外置清洗、清洗較為頻繁（frequency)、設備(shèbèi)維護較為困難（difficult)能耗很低。膜生物反應器膜分離技術與生物處理技術有機結合之新型態廢水處理系統。以膜組件取代傳統生物處理技術末端二沉池，在生物反應器中保持高活性污泥濃度，提高生物處理有機負荷，從而減少污水處理設施占地面積，并通過保持低污泥負荷減少剩余污泥量。主要利用沉浸于好氧生物池內之膜分離設備截留槽內的活性污泥與大分子有機物。膜生物反應器系統內活性污泥（MLSS）濃度可提升至8000~10,000mg/L，甚至更高；污泥齡(SRT)可延長至30天以上。
　　清洗分在線清洗CEP和離線清洗CIP兩種。中空纖維膜紡絲機外形像纖維狀，具有自支撐作用的膜。它是非對稱膜的一種，其致密層可位于纖維的外表面／如反滲透膜，也可位于纖維的內表面(如微濾膜和超濾膜)。對氣體分離膜來說，致密層位于內表面或外表面均可。CEP步驟為清空膜池、快速進藥、慢速進藥、浸泡、清水沖洗、正常運行;CIP步驟為膜清洗池配藥、浸泡、清水沖洗、正常運行。